Isolement des microorganismes possédant une activité anti- Fusarium

Le genre Fusarium Isolement des microorganismes possédant une activité anti- Fusarium
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Résumé

La présente étude a été effectuée dans le but de lutter contre le champignon phytopathogène « le Fusarium« . 8 champignons du genre Fusarium, ont été isolés à partir de différents organes des plantes infectés. l’identification du genre a été effectuée selon les caractères morphologiques, alors que l’identification des espèces a été réalisé par voie moléculaire, au sein du laboratoire du LMBA (Laboratoire de Microbiologie et de Biomolécules Actifs). En effet, d’ après les résultats d’affiliation, les huit souches pathogènes appartiennent à 3 espèces de Fusarium en l’occurrence; Fusarium verticillioides, Fusarium solani et Fusarium oxysporum.

La lutte biologique contre ces phytopathogènes, est mise en évidence en utilisant 7 souches du genre Trichoderma isolées à partie trois sols agricole Algérien.

L’identification moléculaire des isoltats, effectué au sein du laboratoire du LMBA, divise les 7 souches sur 4 principales espèces à savoir: Trichoderma album, Trichoderma harzianumTrichoderma virens, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma viride. Cette étude a, en effet, montré une diversité importante des espèces de Trichoderma en Algérie. Cependant à notre connaissance, aucun travail n’a été publié sur l’isolement de Trichoderma albumTrichoderma virens et Trichoderma longibrachiatum,à partir du sol Algérien.

L’effet de l’activité antagoniste des souches de Trichoderma contres les 8 espèces du Fusarium isolé, a été étudié selon deus méthodes, confrontation directe et indirecte. Les résultats de la confrontation directe montrent un pourcentage d’inhibition varie de 55% à 72% selon les espèces pathogènes et antagonistes testées, alors que les résultats de la confrontation à distance montre des faibles pourcentage d’inhibition varient de 2% a 43%.

Les 7 souches de Trichoderma testées, montrent une capacité considérable de résistance sur les milieux a différents pH de 2 jusqu’au 9.

Le test de l’activité enzymatique des souches antagonistes, prouve que les sept souches testées représentent un usine très important des enzymes lytiques a savoir la chitinase, la cellulase, la protéase, la lipase et la laccase.

Le test de l’activité anti-Fusarium, des filtrats de cultures des souches antagonistes, montrent une faibles inhibition de la croissance mycélienne souches des pathogènes. Par ailleurs, cette étude a montré un changement remarquable de la couleur et de l’aspect des souches de Fusarium et ce, par tout les surnageants de culture testés.

L’effet de l’extrait chloroformique des sept souches antagonistes, a été testé par la technique de BIOLOG ainsi par la technique des disques imbibés, montrent une bonne activité inhibitrice des extraits, et ce en quelque soit la concentration utilisée (50 mg/ml, 25 mg/ml et 1mg/ml).

Mots clés:

Fusarium, Fusariose, lutte biologique, Trichoderma, BIOLOG, extraits fongiques.

Résumé en anglais

This study was carried out in order to fight against the phytopathogenic fungus « Fusarium« . eight species from the genus Fusarium have been isolated from different organs of infected plants. genus identification was conducted using morphological characters, while the identification of species was performed by molecular pathway within the LMBA Laboratory (Laboratory of Microbiology and Biomolecules Assets).

Indeed, according to affiliation results, the eight pathogenic strains belong to three Fusarium species in the circumstances; Fusarium verticillioides, Fusarium solani and Fusarium oxysporum.

Biological control against the phytopathogens is highlighted using seven strains from the genus Trichoderma isolated from three Algerian agricultural soils.

The molecular identification of isolats conducted in the laboratory of LMBA has divided the seven strains into five main species: Trichoderma album, Trichoderma harzianum, Trichoderma virens, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma viride. Indeed, This study showed a significant diversity of Trichoderma species in Algeria. However, to our knowledge, there are no previous published studies on the isolation of Trichoderma album, Trichoderma virens and Trichoderma longibrachiatum, from the Algerian soil.

The effect of the antagonist activity of Trichoderma strains against the eight isolated Fusarium species was studied using two methods, direct and indirect confrontation. Direct confrontation results show a percentage of inhibition ranging from 55% to 72% depending on the tested pathogenic and antagonists species, while the results of the confrontation from distance reveals low percentage of inhibition varied from 2% to 43%.

The seven tested Trichoderma strains show considerable capacity of resistance on the media with a different pH from 2 to 9. Enzymatic activity test of antagonistic strains shows that the seven tested strains represent very important sources of lytic enzymes namely chitinase, cellulase, protease, lipase and laccase.

Both test for anti-Fusarium activity, and culture filtrates antagonistic strains show a low inhibition of mycelial growth of pathogenic strains. Furthermore, this study showed a remarkable change of color and appearance of the Fusarium strains due to antagonistic metabolits.

chloroformic extract effect of the seven antagonistic strains, was tested by the BIOLOG technic and by the technical soaked disks, both techniques show a good inhibitory activity of the extracts, no matter what the concentration used is (50 mg / ml , 25 mg / ml and 1mg / ml).

keywords:

Fusarium , biological control, Trichoderma, BIOLOG, fungal extracts.

Titre

Isolement des microorganismes possédant une activité anti- Fusarium

Langue Francais
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