Caractéristiques et classification des grands groupes de micro-organismes composant les croûtes biologiques

Définition des croûtes biologiques du sol Caractéristiques et classification des grands groupes de micro-organismes composant les croûtes biologiques
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1. Les bactéries

Au sens large, le terme de bactéries regroupe les organismes unicellulaires a organisation de type procaryote, la plupart ont la forme de bâtonnets ou de petites sphères, certaines d’entre elles sont incurvées ou spiralées, d’autres ramifiées, jusqu’à engendrer comme dans le groupes des actinomycètes, un réel mycélium (GOBAT et al., 2003). Les bactéries peuvent être soit autotrophes (ils synthétisent des composés de carbone provenant de sources inorganiques) ou hétérotrophes (c’est à dire, ils utilisent des substrats contenant du ormulercarbone, tels que les matières organiques dans le sol pour la nourriture).

Certaines bactéries contribuent à la fertilité du sol en fixant l’azote. D’autres sont important dans la décomposition de la matière organique (CALVET ,2003).

Les cyanobactéries sont photosynthétiques et leur activité est identique à celle des chloroplastes des Algues et des végétaux. Les bactéries vivent en liberté ou en associations mycorhiziennes avec les racines des plantes (GOBAT et al., 2003).

Les cyanobactéries (anciennement nommées algues bleues) sont des procaryotes photoautotrophes (JEFFERY et al., 2013). Elles ont une grande importance écologique, particulièrement dans le cycle du carbone et de l’azote, ainsi que pour leur signification évolutive (RAVEN et al., 2000)

Les cyanobactéries sont des organismes relativement résistants, elles sont capables de se développer via la photosynthèse en conditions extrêmes de sécheresse (précipitations inférieures à 5 mm par an), et de supporter des périodes décennales sans pluie. Ainsi, on les retrouve à la surface de sols situés en de nombreux endroits de la planète, y compris dans les environnements les plus arides. De plus, les cyanobactéries sont capables de réaliser l’activité photosynthétique en conditions de rayonnement lumineux très intenses, confirmant leur grande résistance et leur capacité de survie dans des milieux difficiles (JEFFERY et al,. 2013).

2.   Actinomycètes

Souvent décrits comme un groupe distinct par les microbiologistes du sol, les actinomycètes sont en fait des Eubactéries Gram positives à structure végétative de type mycélien. Les actinomycètes présentent des similitudes avec les Eubactéries et les Champignons et il existe des formes de transition entre les formes mycéliennes typiques et les formes unicellulaires présentant une aptitude peu marquée à former un mycélium ramifié (ROGER et GARCIA, 2001).

3.   Algues

Les algues microscopiques, unicellulaires ou en colonies filamenteuses, sont souvent abondants dans le sol, mais restent localisées a sa surface ou dans de larges fissures. (GOBAT et al., 2003).

Selon JEFFERY et al. (2013), les algues représentent une partie importante de la microflore édaphique. Elles sont un réservoir de nutriments pour les plantes supérieures. A travers la photosynthèse et la fixation de l’azote, elles apportent du carbone organique et de l’azote dans l’écosystème sol, elles favorisent la structuration des sols et contrôlent l’activité des autres organismes édaphiques. Les algues peuvent supporter la dessiccation, aussi bien que les cyanobactéries. Ces mécanismes d’adaptation aux conditions climatiques extrêmes rencontrées à la surface des sols leur sont donc bien utiles. Cependant, la vitesse de dessiccation peut influencer fortement la survie des algues ; bien plus de cellules algales survivent à des événements de dessiccation courts et intenses qu’a de longues périodes d’assèchement lent des sols.

4.   Champignons

Ce sont des microorganismes non photosynthétiques, regroupent une grande variété d’organismes eucaryotes qui sont divisés en sous-groupes en fonction de critères morphologiques. (ROGER et GARCIA, 2001).

Les champignons existent sous deux formes différentes, soit comme organismes unicellulaires appelés levures soit sous forme d’hyphes, grâce auxquels ils se développent pour former des réseaux ramifiés étendus. La taille des champignons peut varier considérablement, les levures unicellulaires ayant généralement un diamètre de 4-5 μm, alors que les hyphes individuels des champignons filamenteux pouvant former des mycéliums ou thalles. Pouvant s’étendre sur des échelles kilométriques (JEFRRY et al., 2013).

La plupart des champignons sont classés dans un groupe séparé des procaryotes, des plantes et des animaux : les Fungi ou Eumycètes. Ils sont fréquents dans les sols, notamment riches en matière organique, et peuvent constituer une part importante de la biomasse souterraine. Ils ont des rôles majeurs et variés dans le fonctionnement des systèmes ”sols” (BROCK et al., 2007).

5.   Lichens

Les lichens, résultat d’une association entre une algue et un champignon CATIER et ROUX ,2007). Les lichens croissent très lentement et jouent un rôle important dans la formation des sols grâce à leur capacité à produire leur propre nourriture par la photosynthèse et de fournir à leur mort de la matière organique comme substrat pour d’autres organismes. Certaines espèces sont très sensibles à la pollution et peuvent être ainsi utilisées comme indicateurs pour contrôler l’état de leur environnement (JEFFERY et al., 2013)

6.   Bryophytes

Les Bryophytes (dont le nom vient du grec bryos: mousse) se trouvent à l’interface du monde des algues vertes et des plantes vasculaires (RAMEAU et al., 2008). Les Bryophytes sont un embranchement de règne végétal, très homogène, toutes chlorophylliennes, vivants sur le sol, sur l’humus des forêts, sur d’autres végétaux, parfois dans l’eau douce, très rarement dans l’eau saumâtre. Les bryophytes sont dépourvues de vrais tissus vasculaires et de vraies racines (rhizoïdes). Leurs caractères morphologiques et anatomiques leurs exigences écologiques diffèrent suivant les groupes mais elles présentent le même cycle de vie. Ce groupe comprend les hépatiques, les mousses, et les Anthocérotes (MAROUF, 2000).

Source:

KHAMMES, Chaima et OUCIF LEBEHI, Sabrina 2017 . Etude de la relation entre les croûtes biologiques du sol et les plantes sahariennes (Zygophyllum album L.) dans la région d’El Oued.

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